刘琦废除州牧制，改为刺史制度。于此同时加强了刺史的职权有行政、司法等权力，废除了其军事、立法权，可以任命包括太守之下的官员。

同时任命庞统为荆州刺史，持节都督节制荆州兵马；诸葛亮为扬州刺史，持节都督，节制扬州兵马；赖恭为交州刺史，韩嵩为广州刺史。诸葛瑾为荡寇将军，都督交州广州两州兵马。

三省各有明确分工，中书省起草昭书，门下省封驳审议，尚书省负责执行。对于三省制，；中书省和门下省成立的目的，在于分割和限制尚书省的权力。主要掌管zhong yang政令和政策的制定、审核与贯彻执行。

中书省的长官为中书令，副长官为中书侍郎，主要职官有中书舍人。中书省主要负责秉承皇帝旨意起草诏敕；起草之责主要由中书舍人负担。主要官员有刘先，杨仪等；

门下省的长官为侍中，副长官为门下侍郎，主要职官有给事郎主要官员为蒯越，廖立。门下省主要负责纠核朝臣奏章，复审中书诏敕，如认为不当，司以封还和加以驳正，称“封驳”。驳正之权主要由给事中掌握。

中书、门下二省都设在刘琦征南大将军府内，所以又有谏诤之责，设左右谏议大夫、左右补阙、左右拾遗，分属二省（左属门下、右属中书），以匡正大将军的过失。

尚书省设在府外，长官为尚书令，副长官左、右仆she。仆she之下有左右丞、左右司郎中、员外郎、负责都省职事，总领六部。主要有蒯良，鲁肃等。

六部各部长官称尚书，副为侍郎。各司之长为郎中，副为员外郎，分别负责贯彻各种政令。他们对zhong yang担任具体事务的九寺三监（或五监）及地方上的州、郡、县官有领导、监督之权。

“中书取旨，门下封驳，尚书奉而行之”，是三省分工原则，从而彼此制约，以掌管国家大政。三省长官为宰相，台议军国大事于政事堂。用来加强zhong yang集权的调整和补充。

理论上，刘琦是实习的军政分离的政策。但是战乱年代，又是一个人同时处理一个地方更有效率。所以刘琦赋予一个人两个职位，来处理这个局面。但是不会设立一个职位同时能掌握所有权力，避免以后的地方割据势力横行。

勉强设立了三省六部的模型，刘琦就急忙离开了。快过年了，刘琦快马加鞭，急忙回到荆州，原因只有一个他的妻子蔡玉怀孕了。其实临战之前刘琦就刻意的想要孩子了，前两是因为蔡玉还小，怕生出个弱智了。现在刘琦也老大不小了也该有个孩子了。也让忠于刘琦的臣子有个盼头。

让诸葛亮自己相机行事，刘琦带着步练师同陆逊，刘磐等数百护卫先行一步了。蒯越自领大军五万随其后。江东百废待兴，人口锐减。实在拿不出兵马防守，刘琦只好留下四万荆州兵马，用来抵御曹cao。江东虽被攻下，可现在对于刘琦来说，只是个累赘，起码十年之内是这样的。