忠诚情况

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虽然在默认情况下，行星防卫军会受到抵达当地的帝国直属武装力量的指挥，但依然有许多原因可能导致他们加入到叛乱中，并对帝国的统治倒戈相向。混沌势力与外星人（尤其是基因盗窃者）的渗透，星球统治者自身的野心，乃至于其他处于星球上的势力都可能让行星防卫军调转枪口，指向全世界的帝国力量。这是行星防卫军普遍不受信任以及指挥官宁可依赖非当地防卫力量的原因。审判官们尤其不相信本土行星防卫军，只要有机会，他们都将迅速地寻求临近的其他帝国武装力量的帮助。

恒星系防御

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帝国星球也维持着独立于帝国海军的小规模的宇宙舰队，被称为恒星系防御军（SDF）。他们扮演着与帝国海军类似的角色，但装备和规模上则逊色不少。